UVLF в Кошице има центрове за върхови постижения, университетски научен парк и център за компетентност:

- Център за върхови постижения по болести по животните и зоонози - INFEKTZOON (код на проекта ITMS: 26220120002)
- Център за върхови постижения в областта на биомедицинските технологии в партньорство с UPJŠ в Кошице (код на проекта ITMS: 26220120066)
- Център за върхови постижения по паразитология в партньорство с Института по паразитология на Словашката академия на науките в Кошице (код на проекта ITMS: 26220120022)
- Научен парк на Медицинския университет в Кошице (MediPark Košice) в партньорство с UPJŠ в Кошице (код на проекта ITMS: 26220220185)
- Център за компетентност за биомодулатори и хранителни добавки (Probiotech) в партньорство с Института по физиология на добитъка в Кошице (код на проекта на ITMS: 26220220152)
Центровете за върхови постижения играят значителна роля в научноизследователската дейност на университета, издателската дейност, както и във взаимното сътрудничество на междууниверситетските работни места и работни места на Словашката академия на науките.
Изследователският център за върхови постижения INFEKTZOON е единственият CE в UVLF, който не е в партньорство с друга институция. Има амбицията да бъде водещо научно работно място в региона на Източна Словакия и в Словакия в борбата срещу зоонозите и инфекциозните болести на животните и хората в съответствие с текущите нужди на епидемиологичната и епидемиологичната ситуация в държавата, съседния централноевропейски регион и ЕС.
Отделът INFEKTZOON се състои от пет секции, в рамките на които работи широк научен екип, състоящ се от научния капацитет на UVLF в Кошице и партньорска организация, Институтът по паразитология на Словашката академия на науките. Работното място е оборудвано със специални уникални устройства, получени благодарение на финансовата подкрепа от ЕС SF и Словашката република от Оперативната програма за изследвания и развитие.